アミノ酸1文字⇄3文字変換ツール
- 1文字表記から3文字表記に変換したいときは、変換したいアミノ酸配列の1文字表記を大文字で入力してください。
- 3文字表記から1文字表記に変換したいときは、変換したいアミノ酸配列の3文字表記を1文字目は大文字で2・3文字目は小文字で入力してください。
- 各アミノ酸の前後の任意の位置にハイフンマイナス「-」や空白や改行を入力できます。変換の際にそれらは無視されます。
- その他の余計な文字を入力するとエラーになります。
- もっと詳しい使い方の説明はこの下に書いてあります。
詳しい使い方
操作の流れ
- 変換したい1文字表記または3文字表記のアミノ酸配列を「元のアミノ酸配列」欄に入力してください。
- 「1文字から3文字に変換する。」ボタンまたは「3文字から1文字に変換する。」ボタンを押してください。
「1文字から3文字に変換する。」ボタンまたは「3文字から1文字に変換する。」ボタンが押されると、3文字表記または1文字表記に変換した結果の画面が表示されます。
対応しているアミノ酸等
表1に示すように、標準遺伝暗号でコードされる20種類のアミノ酸「ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY」と追加のアミノ酸「UO」、および1個のアミノ酸に特定できない「BZJX」、ならびに（アミノ酸ではありませんが）終止コドン「*」に対応しています。他のマイナーなアミノ酸は非対応です。当ツールでは「X」を不明なアミノ酸として使っているので、「X」を終止コドンとして使いたい場合はご注意ください。
| 1文字 | 3文字 | アミノ酸等 |
|---|---|---|
| A | Ala | アラニン (alanine) |
| C | Cys | システイン (cysteine) |
| D | Asp | アスパラギン酸 (aspartic acid) |
| E | Glu | グルタミン酸 (glutamic acid) |
| F | Phe | フェニルアラニン (phenylalanine) |
| G | Gly | グリシン (glycine) |
| H | His | ヒスチジン (histidine) |
| I | Ile | イソロイシン (isoleucine) |
| K | Lys | リシン (lysine) |
| L | Leu | ロイシン (leucine) |
| M | Met | メチオニン (methionine) |
| N | Asn | アスパラギン (asparagine) |
| P | Pro | プロリン (proline) |
| Q | Gln | グルタミン (glutamine) |
| R | Arg | アルギニン (arginine) |
| S | Ser | セリン (serine) |
| T | Thr | トレオニン (threonine) |
| V | Val | バリン (valine) |
| W | Trp | トリプトファン (tryptophan) |
| Y | Tyr | チロシン (tyrosine) |
| U | Sec | セレノシステイン (selenocysteine) |
| O | Pyl | ピロリシン (pyrrolysine) |
| B | Asx | アスパラギン または アスパラギン酸 |
| Z | Glx | グルタミン または グルタミン酸 |
| J | Xle | ロイシン または イソロイシン |
| X | Xaa | いずれかのアミノ酸 |
| * | Ter | 終止コドン |
入力できる文字列
1文字から3文字に変換する場合は、表1の「1文字」の列に記載した文字が入力できます。「*」以外はすべて大文字で入力してください。小文字は受け付けません。任意の位置にハイフンマイナス「-」や空白や改行を入力することができ、変換の際にそれらは無視されます。
3文字から1文字に変換する場合は、表1の「3文字」の列に記載した文字列が入力できます。1文字目は大文字で、2・3文字目は小文字で入力してください。そうなっていないものは受け付けません。ただし終止コドンは「Ter」の他に「Term」・「TERM」・「Stop」と入力することもできます。アミノ酸とアミノ酸の間および先頭と末尾に任意にハイフンマイナス「-」や空白や改行を入力することができ、変換の際にそれらは無視されます。1個のアミノ酸の3文字表記の途中に空白等を入れるとエラーになります。アミノ酸とアミノ酸の間に空白等を入れず続けて書くこともできます。入力できる文字数は合計64000文字までです。
こういうところで全角文字を使う人はあまりいないと思いますが一応全角文字も使えます。ここに記載していない文字列を入れるとエラーになります。
結果の画面の見方
「1文字から3文字に変換する。」ボタンが押されたときは、表1の「3文字」の欄の表記に変換されたアミノ酸配列が「3文字表記に変換したアミノ酸配列」欄に表示されます。アミノ酸とアミノ酸の間には1個の空白が入ります。
「3文字から1文字に変換する。」ボタンが押されたときは、表1の「1文字」の欄の表記に変換されたアミノ酸配列が「1文字表記に変換したアミノ酸配列」欄に表示されます。
結果の欄の上の「結果をコピー」ボタンを押すと結果がクリップボードにコピーされます。うまくいかないときは手動で結果の欄の全体を選択してコピーしてください。Windowsをご利用の場合は結果の欄の中のどこかにカーソルを合わせてからCtrl+Aを押せば配列全体を選択することができます。この欄は読み取り専用になっており手動で書き換えることはできませんので、コピーするときに手が滑ってキーを押してしまっても書き換わってしまう心配はありません。
その下の「元のアミノ酸配列」欄には変換前の元のアミノ酸配列が表示されます。
続けて別のアミノ酸配列を変換したいときは、「元のアミノ酸配列」欄を書き換えて別の配列を入力してから「1文字から3文字に変換する。」ボタンまたは「3文字から1文字に変換する。」ボタンを押せば変換できます。いちいち最初の画面に戻る必要はありません。
「前回の配列に戻す。」ボタンを押せば書き換える前の「元のアミノ酸配列」が復元されます。いったん「元のアミノ酸配列」欄を書き換えてしまった後で、今表示されている変換後のアミノ酸配列が何の変換結果なのかわからなくなったときなどに有用です。
エラーメッセージ
当ツールで対応していない内容が入力されて「1文字から3文字に変換する。」ボタンまたは「3文字から1文字に変換する。」ボタンが押されたときは、エラーメッセージが表示されます。使えない文字が入力されたためにエラーになった場合は、エラーの原因となった文字の一覧が紫枠内に表示されるので、それを参考にしてやり直してください。
紫枠内に文字が何も無さそうに見えるときは、見えない文字が混入しています。どこかからコピー&ペーストしてくるとそのようなことが起きやすくなります。その場合はコピー&ペーストしないで1文字ずつ手動で入力してください。
プライバシーポリシー
2021年12月24日制定
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- 今後の機能・性能改善のため、以下の情報をログとして記録します。
- 入力された総文字数および総アミノ酸数
- 「1文字から3文字に変換する。」ボタンと「3文字から1文字に変換する。」ボタンのどちらが押されたかの情報
- エラーが発生した場合は、エラーメッセージの内容
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